С 1 января 2026 года вводятся три вида постановки на учет по НДС: добровольная, обязательная и условная.
Обязательная регистрация по НДС
Обязательной постановке на учет подлежат налогоплательщики, чей годовой оборот достигает или превышает 10 000 МРП (по состоянию на 1 января соответствующего финансового года). Для регистрации плательщик обязан подать налоговое заявление не позднее 5 рабочих дней после превышения порогового значения оборота. Если речь идет о скоро состоящей сделке, которая приведет к превышению порога, заявление подается до совершения такой операции.
От обязанности обязательной регистрации по НДС освобождены:
- государственные учреждения;
 - структурные подразделения юридических лиц-резидентов;
 - лица, занимающиеся частной практикой;
 - налогоплательщики на специальных налоговых режимах (включая СНР для самозанятых, на основе упрощенной декларации, для крестьянских хозяйств);
 - физические лица.
 
Дифференцированные ставки НДС
С 1 января 2026 года в Казахстане вводятся дифференцированные ставки налога на добавленную стоимость:
- 16% — на облагаемый оборот и облагаемый импорт;
 - 5% — применяется с 1 января 2026 года;
 - 10% — с 1 января 2027 года, в отношении реализации и импорта:
 - лекарственных средств (за исключением товаров в рамках ГОБМП и ОСМС, а также для лечения орфанных заболеваний);
 - медицинских изделий, комплектующих, технических вспомогательных (компенсаторных) средств;
 - медицинских услуг (за исключением услуг, оказанных по ГОБМП, ОСМС или для лечения орфанных заболеваний);
 - 10% — для отечественных периодических печатных изданий.
 
Для производителей и переработчиков сельскохозяйственной продукции, товаров аквакультуры (включая крестьянские и фермерские хозяйства по статье 490 Налогового кодекса), размер суммы НДС, относимого в зачет, увеличивается до 80%.
Снятие с учета плательщика НДС
Плательщик снимается с учета по НДС при:
- переходе с общеустановленного порядка налогообложения на специальный налоговый режим;
 - прекращении деятельности либо ликвидации.
 
При переходе на СНР необходимо вместе с уведомлением о смене режима предоставить ликвидационную налоговую отчетность.
Приостановление выписки электронных счетов-фактур (ЭСФ)
В Налоговый кодекс введён порядок приостановления выписки ЭСФ налоговым органом. Приостановка осуществляется в течение одного рабочего дня после возникновения таких ситуаций, как:
- неисполнение или признание неисполненным уведомления о подтверждении оборота по реализации товаров, работ, услуг;
 - неисполнение уведомления о подтверждении местонахождения плательщика;
 - просрочка подачи налоговой отчетности по НДС более шести месяцев;
 - приостановка подачи отчетности по НДС до даты возобновления подачи;
 - вступление в силу судебных решений о признании недействительной регистрации или перерегистрации юридического лица, либо индивидуального предпринимателя;
 - вступление в силу решения суда о признании первого руководителя или ИП недееспособным, ограниченно дееспособным, безвестно отсутствующим или умершим;
 - вступление в силу приговора по соответствующим статьям УК РК в отношении первого руководителя или единственного участника лица;
 - объявление розыска первого руководителя;
 - отсутствие связанной с трудовой деятельностью цели пребывания иностранного руководителя, либо истечение срока его разрешённого пребывания;
 - включение ИП или юридического лица в реестр бездействующих налогоплательщиков;
 - неисполнение уведомлений о расхождениях, выявленных камеральным контролем.
 
Приостановка выписки ЭСФ отменяется налоговым органом в течение одного рабочего дня после устранения причин.